تعمل إدارة التنظيم الصحي على إعداد وتطوير الأنظمة والسياسات والمعايير اللازمة للنمو المستمر للقطاع الصحي في إمارة الشارقة. و هي تشرف على المنشآت الصحية والمهنيين الصحيين المرخصين من قبل هيئة الشارقة الصحية من خلال التصريح للمنشآت و المهنيين لمزاولة المهنة وفق المعايير والضوابط المعتمدة، بالإضافة إلى الرقابة و التفتيش على المنشآت و المهنيين للتأكد من الالتزام بالضوابط و الاحكام المعمول بها في هذا الشان. وتعمل أيضاً على إدارة ومتابعة الحوكمة الطبية في مدينة الشارقة للرعاية الصحية لتحقيق رؤية صاحب السمو حاكم إمارة الشارقة بإنشاء مدينة صحية عالمية تقدم خدمات صحية بأعلى المعايير لسكان إمارة الشارقة والإمارات الأخرى